Resumen: En noviembre de 2021 se informó sobre una nueva variante de preocupación (VoC) de SARS-CoV-2, la llamada variante Ómicron (B.1.1.529), que llamó la atención de los expertos por su elevado número de mutaciones en la proteína S. Presentamos a un paciente masculino de 51 años proveniente de Sudáfrica que comienza con síntomas respiratorios a las 48 horas de su llegada a la Ciudad de México. Durante su estancia en urgencias se obtuvo prueba de antígeno y RT-qPCR para SARS-CoV-2 positivas, con mínima alteración de parámetros de laboratorio y sin evidencia de afección pulmonar por tomografía. El paciente presentó evolución favorable y fue dado de alta seis días después. El día 29 de noviembre se recibió la notificación del Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos (InDRE) de que se trataba de la variante Ómicron del virus SARS-CoV-2.

Abstract: On November 2021 a new SARS-CoV-2 variant of concern (VoC), named Omicron (B.1.1.529) was reported. This variant draw attention for its high number of mutations on the S protein. We present a 51 year old male, from South Africa who started with respiratory symptoms 48 hours after his arrival to Mexico City. During his stay at the ER a positive antigen and positive RT-qPCR were obtained. Minimal laboratory alterations were observed with no evidence of lung involvement on the CT scan. The outcome was favorable and was discharged six days later. On November 29, a notification from InDRE was received, reporting that the sequence obtained was compatible with SARS-CoV-2 Omicron variant.

Resumen El cultivo de la caña de azúcar representa una parte importante en la economía de Colombia debido a las diversas aplicaciones en industrias como licor, alimentos, papel y biocombustibles. Su producción en todo el mundo se ve afectada por la presencia de agentes fitopatógenos, principalmente hongos filamentosos como Physalospora tucumanensis (agente causal de la enfermedad “Pudrición roja”) y Fusarium spp. Hasta la fecha, en Colombia, no se ha reportado la enfermedad de Pokka boheng en este cultivo cuyo agente causal es el hongo Fusarium verticillioides, por lo que es necesario identificar adecuadamente este microorganismo, responsable de las pérdidas en productividad y contaminación de los alimentos. Con el fin de aislar e identificar el agente infeccioso de los tejidos sintomáticos, se realizó la desinfección y posterior siembra de éstos en medios de cultivo extracto de malta (2 %) y extracto de levadura (0.2 %) tanto líquido como sólido durante 7 días. A partir de varias placas petri, se realizó la respectiva purificación y una caracterización morfológica basada en la forma y el color del micelio, así como el tipo de esporas generadas. Adicionalmente, el material genético se extrajo y se amplificaron los marcadores genéticos (ITS, factor de elongación 1-α (EF) y β-tubulina (Btub)) por PCR. Luego, se utilizó la secuenciación del ADN para obtener los datos para realizar una reconstrucción filogenética mediante métodos probabilísticos (máxima verosimilitud e inferencia bayesiana). La cepa aislada, nombrada como EA-FP0013 se localizó en el grupo del complejo Fujikuroi, con una alta identidad probable para Fusarium verticillioides. Por lo tanto, la identificación temprana y específica de especie de estos aislados fúngicos, utilizando métodos moleculares, puede permitir el diagnóstico oportuno de enfermedades fisiopatológicas emergentes de interés para la región, y así proponer las estrategias de control respectivas.

Abstract The cultivation of sugarcane represents an important part in the Colombian economy due to the diverse applications in industries like liquor, food, paper and biofuels. Sugarcane worldwide production is affected by the presence of phytopathogenic agents, mainly filamentous fungi such as Physalospora tucumanensis (red rot disease) and Fusarium spp. To date in Colombia, Pokka boheng disease whose causal agent is the fungus Fusarium verticillioides, has not been reported, which is why it is necessary to identify appropriately this microorganism, responsible for losses in productivity and food contamination. In order to isolate and identify the infectious agent from symptomatic tissues, disinfection and culture in liquid and solid culture mediums were performed in malt extract (2%) and yeast extract (0.2%) both liquid and solid, for 7 days. After several replicates in agar plate, a purification was made along with a morpho- logical characterization based on the shape and color of the mycelium, as well as the type of spores generated. Additionally, the genetic material was extracted and gene markers (ITS, Elongation Factor 1-α (EF) and β- Tubulin (Btub)) were amplified by PCR. Then, DNA sequencing was used to obtain the data to make a phylogenetic reconstruction by probabilistic methods (Maximum Likelihood and Bayesian Inference). The isolated strain, named as EA-FP0013 was located in the Fujikuroi complex group, with high probable identity to Fusarium verticillioides. Thus, early and species-specific identification of these fungal isolates by molecular methods may allow the timely diagnosis of emerging pathophysiological diseases of interest in the region, and thus propose the respective control strategies.

Introducción. Existen pocos datos sobre los defectos que afectan el desarrollo y función de los linfocitos asesinos naturales ( natural killers, NK) en pacientes con un incremento anormal en la recurrencia de infecciones. Objetivo. Realizar una evaluación sistemática de las diferentes subpoblaciones y la función de estas células en pacientes con infecciones recurrentes. Materiales y métodos. Se incluyeron 20 pacientes con infecciones graves o recurrentes y se analizaron las subpoblaciones y la respuesta citotóxica de los linfocitos NK en sangre periférica. Los resultados de los pacientes se compararon con controles sanos pareados por edad y sexo. Resultados. Los pacientes con episodios infecciosos activos presentaron anormalidades transitorias en el porcentaje o el número absoluto de linfocitos NK. Se caracterizaron, además, cinco pacientes con alteraciones persistentes en la distribución de las subpoblaciones de linfocitos NK. Estas alteraciones se debieron principalmente a la disminución de células CD56 dim CD16 bright . Se evidenciaron, también, defectos en la función de los linfocitos NK en algunos de nuestros pacientes; sin embargo, estas alteraciones fueron transitorias y se asociaron principalmente a la fase activa de la enfermedad. Conclusiones. Nuestros resultados evidencian defectos transitorios en el número y función de los linfocitos NK en pacientes con infecciones recurrentes o graves, además de alteraciones persistentes en los LNK CD56 dim CD16 bright en algunos individuos. Es necesario profundizar en los mecanismos que conllevan al desarrollo de estos defectos inmunes y estudiar cómo estas alteraciones influyen en la respuesta inmune.

Introduction: The information about defects affecting natural killer cell (NK) development and activity in patients with an abnormal increase of recurrent infections is scarce. Objective: To perform a systematic analysis of NK abnormalities in patients with recurrent infections. Materials and methods: Our study enrolled twenty patients with severe or recurrent viral infections. Natural killer cell subsets, surface receptors expression and cytotoxicity were analyzed. Results were compared with those from age- and sex-matched healthy controls. Results: Transient alterations were observed in the percentages and absolute numbers of NK cells in patients with infection active episodes. We also described five patients with stable disturbances in the distribution of NK cell subpopulations. These defects are mainly due to a decrease in the CD56 dim CD16 bright cells in peripheral blood. In addition, NK cell function abnormalities were observed in some patients, however, those were always transient and mainly associated to active disease. Conclusions: These findings demonstrate transient alterations in the percentages and absolute numbers of NK cells in patients with recurrent or severe infection. Also, stable disturbances in CD56 dim CD16 bright NK cells are observed in these patients. Nevertheless, these parameters must be thoroughly studied to determine the mechanisms that entail these immune abnormalities and investigate how they alter the immune response.

OBJECTIVE. To analyze the motives for using and not using pedestrian bridges (PB). MATERIAL AND METHODS. A cross-sectional survey was conducted of a sample of pedestrian users and non-users of PB; a logistic regression model was used to analyze the motives for use and non-use. RESULTS. The prevalence of non-use was 50.5 % of 813 surveyed pedestrians; the principal reason to use a PB was safety, and not to use it was "laziness". There were significant differences when analyzing the reason of non-use in the age groups 19 to 36 years, adjusted for education and physical characteristics of the PB ([aOR=1.7; 95 % CI=1.06-2.86] and [ORa.1.9; 95 % CI=1.14-3.33], respectively). CONCLUSIONS. The results of this study allow us to identify important aspects to consider "from the perspective of the pedestrians" when constructing new PB and improving existing PB to increase use in areas with a high risk of pedestrian injuries.

OBJETIVO. Analizar los motivos de uso y no uso de puentes peatonales (PP). MATERIAL Y MÉTODOS. Se empleó un diseño transversal, a partir de una muestra de peatones usuarios y no usuarios de PP; se utilizó regresión logística para identificar los factores que influyen en el uso y no uso de PP. RESULTADOS. La prevalencia de no uso fue 50.5% en 813 peatones entrevistados; la principal razón para usar PP fue "seguridad", del no uso fue "flojera". Hubo diferencias significativas al analizar motivos de no uso de PP en las edades de 19 a 36 años, ajustando por escolaridad y características físicas del PP, con RMa. 1.7 (IC95% 1.06-2.86) y RMa. 1.9 (IC95% 1.14-3.33), respectivamente. CONCLUSIONES. Los resultados de este estudio permiten identificar aspectos importantes a considerar desde la perspectiva de los peatones, antes de construir nuevos PP, así como aquéllos que deben mejorarse para incrementar su uso en zonas de alto riesgo de lesiones por atropellamiento.

OBJECTIVE. To analyze the motives for using and not using pedestrian bridges (PB). MATERIAL AND METHODS. A cross-sectional survey was conducted of a sample of pedestrian users and non-users of PB; a logistic regression model was used to analyze the motives for use and non-use. RESULTS. The prevalence of non-use was 50.5 % of 813 surveyed pedestrians; the principal reason to use a PB was safety, and not to use it was "laziness". There were significant differences when analyzing the reason of non-use in the age groups 19 to 36 years, adjusted for education and physical characteristics of the PB ([aOR=1.7; 95 % CI=1.06-2.86] and [ORa.1.9; 95 % CI=1.14-3.33], respectively). CONCLUSIONS. The results of this study allow us to identify important aspects to consider "from the perspective of the pedestrians" when constructing new PB and improving existing PB to increase use in areas with a high risk of pedestrian injuries.

OBJETIVO. Analizar los motivos de uso y no uso de puentes peatonales (PP). MATERIAL Y MÉTODOS. Se empleó un diseño transversal, a partir de una muestra de peatones usuarios y no usuarios de PP; se utilizó regresión logística para identificar los factores que influyen en el uso y no uso de PP. RESULTADOS. La prevalencia de no uso fue 50.5% en 813 peatones entrevistados; la principal razón para usar PP fue "seguridad", del no uso fue "flojera". Hubo diferencias significativas al analizar motivos de no uso de PP en las edades de 19 a 36 años, ajustando por escolaridad y características físicas del PP, con RMa. 1.7 (IC95% 1.06-2.86) y RMa. 1.9 (IC95% 1.14-3.33), respectivamente. CONCLUSIONES. Los resultados de este estudio permiten identificar aspectos importantes a considerar desde la perspectiva de los peatones, antes de construir nuevos PP, así como aquéllos que deben mejorarse para incrementar su uso en zonas de alto riesgo de lesiones por atropellamiento.